呼倫貝爾農墾開發建設始于1954年，國家提供大量資金建設種畜基地。1955年正式成立呼倫貝爾盟農牧場管理局。1960年，時任國家農墾部部長王震從內地和黑龍江農墾抽調大批轉復官兵到呼倫貝爾開荒建場，當年開荒300余萬畝。到1961年達到435萬畝，形成了目前呼倫貝爾農墾的產業基礎和規模。1969年劃歸黑龍江，1976年劃回呼倫貝爾。1980年分設海拉爾農牧場管理局和大興安嶺農場管理局。2000年內蒙古自治區黨委確定兩局為自治區直屬國有重要骨干企業。2002年兩局下放為呼倫貝爾市直屬企業。2003年兩局分別改制成立海拉爾農墾(集團)有限責任公司和大興安嶺農墾(集團)有限責任公司。2012年海、大兩個集團再度整合，重組成立為呼倫貝爾農墾集團。